国内传统医科院通常仅有院内项目，经费仅面向本院科研人员。深圳医科院将仿效NIH，同时设立院内、院外项目，院外项目通过“招标制”“悬赏制”“赛马制”等多种方式，向粤港澳大湾区、全国甚至及全球开放，资助院外机构或学者开展研究或跨领域间的合作研究。

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